牙周病的病因是基于两点，一点是细菌，另一点是自身免疫力，这个细菌指的是牙周致病菌，而这个自身免疫力，并不是指免疫力的强弱，而是对某个特定的牙周致病菌是不是敏感。所以并不是说得牙周炎的人免疫力一定低，或者说身体很好从来不感冒的人不会得牙周病。在大多数情况下，80%的牙周病的发生，都是因为忽视口腔卫生或者刷牙方法错误导致的口腔内牙周细菌超标，细菌不断积累增加，导致机体的免疫细胞没法清除过多的致病细菌，而发生的疾病破坏。而我们经常提到的牙结石，牙菌斑，就是这些细菌的老窝。我们经常强调的刷牙，洗牙，牙线，冲牙器这些物理清除方式的目的都只有一个，就是清除这些细菌的老窝，让自身免疫力重新建立防线，来抵挡这些剩余的细菌。

牙周病最基本的致病原理，除去细菌和免疫力，还有另外两个很大的因素就是糖尿病和吸烟。基本上，糖尿病患者得牙周病的几率是非糖尿病的3倍，且糖尿病的第六大并发症就是牙周病，而抽烟的人得牙周病的几率是不吸烟人的4-8倍。除此之外其他系统疾病比如类风湿关节炎，免疫疾病，骨质疏松和精神压力等，多多少少跟牙周疾病有关。主要说来，导致牙周病的还是细菌，免疫力，糖尿病和吸烟。